Der gebürtige Münchner Jonathan Meier durchlief die Nachwuchsschulen von 1860 und dem FC Bayern. Beim Rekordmeister trainierte er regelmäßig mit den Profis und stand viermal im Bundesliga- sowie einmal im Champions-League-Kader, ohne jedoch zum Einsatz zu kommen. Mit den Bayern-Amateuren gelang ihm dagegen der Aufstieg in die Dritte Liga. Anschließend wechselte „Joni“ zum FSV Mainz 05, wo ihm der Durchbruch in der höchsten deutschen Spielklasse allerdings ebenso verwehrt blieb. 2020 kam der Linksfuß für ein Jahr nach Dresden und stieg mit Dynamo in die 2. Bundesliga auf, im Jahr darauf ging es erneut per Leihe zu Hansa Rostock. 2022 folgte dann der endgültige Wechel nach Elbflorenz.
